Los análisis climatológicos, tienen como fin primordial, por una parte, caracterizar los principales elementos constitutivos del clima del área y su variación en el tiempo y en el espacio; por otra parte, emplear los valores medios obtenidos para los elementos del clima, con el fin de calcular las variables que intervienen en el balance hídrico de una región o zona determinada.
El clima que se presenta en el territorio de San Jacinto es un clima tropical influenciado por los vientos alisios que soplan durante el primer semestre del año, con lluvias regulares entre los meses de Abril, Julio, Septiembre y Noviembre.
Anualmente se presentan precipitaciones que oscilan entre los 1.000 y 1.400 mm al año, con mayor intensidad en el segundo semestre del año. San Jacinto Ocupa el segundo lugar en el departamento de los municipios con mayor cantidad anual de precipitación; la humedad relativa es de 75 %.
La temperatura promedio es de 27˚ C, condiciones climáticas típicas de las antiguas sabanas de Bolívar.